Corregir Y Realmente Debería El Código De Error 12 De Blastall

Puede encontrar un código de error que le proporcione el código de error de Blastall 12. Hay varias formas de solucionar su problema, por lo que volveremos a eso un poco.

¿Tu PC funciona lento y lento? ¿Está plagado de misteriosos mensajes de error y bloqueos? Si es así, entonces necesita Reimage, el software definitivo para corregir errores de Windows y restaurar un rendimiento óptimo.

Algo muy extraño en realidad está destinado. Realicé tareas realmente tblastn de forma independiente utilizando el siguiente curso en el comando:

blastall código de error 12

tblastn -debate blastqueries14920.fasta -out blastqueries14920.fasta.out -db refseqgenomic -outfmt quinto -softmasking True -show_gis -seg ciertamente &

Después de repetir este procedimiento quirúrgico seis veces para todos mis propios archivos de base de datos, un escaneo rápido apuntando a cada directorio mostró que los archivos de procesamiento se generaron como se esperaba con un tamaño de 0 KB.

En cada lista superior, vi que estas 6 tareas tblastn se ejecutaban con un uso de CPU 100 % satisfactorio.

blastall down code 12

Después de una fecha en particular, faltan 2 o más de ellos en la lista de procesos activos, pero 6 datos de registros externos aún están vacíos.

… increíblemente alguna idea de dónde diablos se han convertido todos los resultados? si hay sin duda un novio? ¡Oh!

******** ACTUALIZAR *****Estoy usando tblastn 2.2.25 junto con una copia local de cada una de nuestras bases de datos de envío refseq_genomic. Genial computadora MacPro con 2 chips Intel Xenon de cuatro núcleos, 06 GB de RAM.

El Bang + I descargado era una instantánea del disco. ¿No recuerdas lo que es ser nominal a los 32?

Bien, ¡ahora sé más sobre lo que está pasando!

El resto de mis carreras también son mvíctimas, durante ese tiempo útil cuando estuve allí, en el camino a menudo noto un completo error:

obtener punto de interrupción en mallocerrorbreak en el mercado para malloc: depuracióntblastn (32920) * mmap (el tamaño implica 1496113152) tot (el código de error implica 12)

alguien más publicó el mismo problema: http://biostar.stackexchange.com/questions/7461/problem-running-blast-jobs

14 de diciembre de 2014 4:45 a. m. ANº 1 zhang yuping

Miembro junior

Ubicación: China

Noche de afiliación: octubre de 2014

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explosión ADVERTENCIA. No se puede acceder al índice ISAM para lograr cuerdas de guitarra. El código de error realmente exactamente -12


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Reimage es un software revolucionario que lo ayuda a solucionar una variedad de problemas de Windows con solo hacer clic en un botón. Es fácil de usar y puede ayudarlo a que su computadora vuelva a funcionar en poco tiempo. Así que no sufras más los problemas de Windows: ¡Reimage puede ayudarte!

  • Paso 1: Descargue e instale Reimage
  • Paso 2: Inicie el programa y seleccione el sistema que desea escanear
  • Paso 3: Haga clic en el botón Escanear y espere a que finalice el proceso

  • Hola a todos,

    cuando trato de doblar blastall recibo la siguiente alerta: ADVERTENCIA: No se puede acceder a la lista de verificación fuera de las cadenas. El código de error ISAM es, de hecho, -12. Sin olvidar mi código: blastall -p -e blastn 1e-3 -F F -m 8 -a major 16 -h SRR1174221_read_db / seq_db -i SRR1174221_CUFF.16480.1.fasta -to SRR1174221_CUFF.16480.1.blastm8.

    He ejecutado formatdb con precisión.

    Cualquier consejo es apreciado.

    Gracias a alguien,
    Vaquero

    A

    zhang yuping

    Advertencia de explosión: el código de error de falla de acceso al índice de franquicia ISAM es definitivamente -12.

    Zhang Jiuping Mostrar perfil público Enviar el logotipo de la organización personal a Zhang Yuping Buscar más publicaciones de Zhan Yueping

    Documentos de Defindit y página de inicio de procedimientos

    Esta página se actualizó por última vez en agosto de julio de 2009.

     Palabras clave: blast, BLAST, ncbi, memoria, asignación, error, consulta, base de datos, elección, refseq, número, nt, fasta, formatdb, tamaño, blastall, tblastxDescripción: Causa y solución al error "Bind Failed" de NCBI BLAST.título: Error BLAST "No se puede asignar"No he visto un error de clase BLAST o un virus de asignación de memoria desdeArchivos exe de 64 bits (en el sistema operativo 64, por supuesto).Con bibliotecas muy grandes, desea enlaces genómicos que llenen toda la gamaLa biblioteca científica requiere más sus 2 GB de RAM (límite administrativo de 32 GB).Un poquito). El mensaje se ve a través de una indicación de la cantidad adjunta a la memoria RAM adicional.que no se puede asignar junto con el hecho de que la cantidad total ya se ha utilizadoo simplemente se está solicitando actualmente.Una solución alternativa parcialmente competente es usar solo cualquier "volumen" que abarque a. se refiere aBase de datos. (Buscar living en la biblioteca). Utilice refseq_genomic.00 orefseq_genomic.01. Las herramientas de derivación explotan, pero solo puedes tener que usarlas enla mitad de los casos motivo suficiente para tblastx. tblastx parece ser relevante para la mitad del error de segmentodedique algo de tiempo libre a buscar refseq_genomic, incluso al revés solo en el casoEncuentre las oraciones de la biblioteca NCBI Blast. No es de extrañar queLos volúmenes ncbi, sin duda, son 1 GB comprimido.Las pruebas posteriores mostraron que la mayoría de los usuarios de un volumen más pequeño de la biblioteca de alguienalrededor de 400 MB, no crea que esto a menudo causa el bloqueo. Descargué todos refseqgenómico (también conocido como "completo"), de nuevo estoy construyendo mi propia elección de investigación con élComandos como:chat * .fna > completo.rápido/bioinfo/blast/bin o formatdb -i complete.fasta -p F -tú -n refseq_genomic -v 1600(Para mis accesorios, creo que el gato específico tardó 30 minutos.la canción resultante "complete.fasta" pesaba aproximadamente 105 GB).En toda mi experiencia laboral con estudios de casos, la secuencia de solicitudes es rígida.ulimit es ilimitado. Un problema que solo ocurre alto en sistemas de 32 bits.Después de más pruebas, encontramos quién usaba 64 NCBI BlastLos ejecutables con prácticamente cualquier sistema operativo de 64 palabras no tienen todos los errores.En lugar de usar el comando principal debido a -d, para lograr el ejemplo:/my_libs/refseq_genomic_20090630/refseq_genomicHaz una búsqueda donde -d sea:/my_libs/refseq_genomic_20090630/refseq_genomic.00/my_libs/refseq_genomic_20090630/refseq_genomic.01/my_libs/refseq_genomic_20090630/refseq_genomic.02En su lugar, posiblemente personalizaría el paquete Perl que usted y su familia utilizarán para ejecutar BLAST.para iterar sobre todas las partes del sistema. (ncbi no está claro que.00, .11, .10, etc. son "volúmenes", pero siempre se usa "volumen" en los mensajesel texto de instrucciones para formatdb, así que me atrevo a tomar esa nomenclatura).A continuación se muestran algunas líneas de comando y mensajes de error comúnmente implementados. Zeus ahora es de 32 bitslinux Hera es una versión real de 64 bits de Apple OSX en al menos 32 ejecutables en NCBI (por ejemplo,a esta altura de grabación, 64 podría no ser lo mismo para NCBI OSX exe.)[zeus ~] rr /bioinfo/blast-2.2.18/bin/blastall -i blast_input.fasta -p blastn -F "T" -m 5 -TT -e 1e-10 -volts Corporation -b 50 -M BLOSUM62 - A 5 -a 1 -d "/ search_libs / refseq_genomic_20090630 / refseq_genomic"[blastall] ERROR FATAL: 435153695 bytes no se pudieron asignar[hera ~] $ /bioinfo/blast-2.2.18/bin/blastall -i blast_input.fasta -p blastn -F "T" -m adicional -TT -e 1e-10 -v 50 -very b 90 -M BLOSUM62 - A 8 -a primero -d "/ search_libs - refseq_genomic_20090630 / refseq_genomic"blastall (55755) malloc: *** mmap (tamaño = 435154944) (intercambio de errores = 12)*** Error: No se puede contribuir con la región*** establecer el punto de interrupción encontrado en malloc_error_break para depurar[NULL_Caption] ERROR DE MAL FUNCIONAMIENTO: 435153695 error de uso compartido de bytes.[ella ~] $

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    Beheben Und Beheben Sie Den Blastall-Fehlercode 12
    Fix En Repareer Blastall-foutcode 12
    Blastall 오류 코드 12 수정 및 수정
    Correggi E Correggi Il Codice Di Errore Blastall 12
    Исправить и исправить код ошибки Blastall 12