Исправить и исправить ошибку Blastall с кодом 12

Вы можете найти код ошибки, который отображает конкретный код ошибки Blastall 12. Должно быть несколько способов исправить этот недостаток, поэтому мы немного вернемся к одному из них.

Ваш компьютер работает медленно и вяло? Он страдает от загадочных сообщений об ошибках и сбоев? Если это так, то вам нужен Reimage — лучшее программное обеспечение для исправления ошибок Windows и восстановления оптимальной производительности.

На самом деле происходит что-то очень странное. Я выполнил несколько задач tblastn независимо, используя следующую строку по всей команде:

blastall код ошибки 12

tblastn -query blastqueries14920.fasta -out blastqueries14920.fasta.out -db refseqgenomic -outfmt многочисленный -softmasking True -show_gis -seg конечно &

После повторения этой операции полдюжины раз для всех моих файлов системы хранения, быстрое сканирование любого каталога показало, что выходные компьютерные данные были сгенерированы, как и ожидалось, только размером 0 КБ.

В самом большом списке я увидел, что моя половина задач tblastn выполнялась при 100% удовлетворительном использовании ЦП.

blastall error promo code 12

Через день или около того 2 или более из них отсутствуют в динамическом списке всех операций, но 6 внешних файлов, несомненно, все еще пусты.

… так что есть идеи, где, черт возьми, все результаты? если есть то ты просто бойфренд? Ой!

******** ОБНОВЛЕНИЕ *****Я использую tblastn 2.2.25 с правильной локальной копией базы данных ввода refseq_genomic. Классный компьютер MacPro с 2 . 5 четырехъядерных чипов Intel Xenon, 16 ГБ оперативной памяти.

Скачал Bang+, у меня была снапшот версия с диска. Разве ты не знаешь, каково это быть маленьким около 32 лет?

Хорошо, теперь я больше разбираюсь в том, что происходит!

Остальные мои расы также были жертвами, в течение того драгоценного вашего времени, когда я был там, чтобы обычно замечать полную ошибку:

предустановленная точка останова в mallocerrorbreak to malloc: отладкаtblastn (32920) * mmap (размер равен 1496113152) tot (код ошибки = 12)

мужчина или женщина также опубликовали такое же беспокойство – http://biostar.stackexchange.com/questions/7461/problem-running-blast-jobs

<таблица>

<тд> 12 декабря 2014 г. 4:45

<тд>А№ 1 <тд><случаи>Чжан Юепин

Младший участник

<случаи>

Местоположение: Китай

Дата регистрации: октябрь 2014 г.

Сообщений: 6

<тд><случаи>ПРЕДУПРЕЖДЕНИЕ. Невозможно получить доступ к индексу ISAM для гитарных струн Мартина. Код ошибки правильный -12

<размер часов = "1">

Рекомендуется:

Reimage – это революционное программное обеспечение, которое помогает устранять различные проблемы с Windows одним нажатием кнопки. Он прост в использовании и может помочь вам восстановить работоспособность вашего компьютера в кратчайшие сроки. Так что не страдайте больше от проблем с Windows - Reimage может помочь!

  • Шаг 1. Загрузите и установите версию Reimage.
  • Шаг 2. Запустите программу и выберите систему, которую хотите сканировать.
  • Шаг 3. Нажмите кнопку "Сканировать" и дождитесь завершения процесса.

  • Привет всей семье,

    когда я пытаюсь обратиться к blastall, я получаю следующее предупреждение: ПРЕДУПРЕЖДЕНИЕ: Не удается получить доступ к контрольному списку сообщений. Код ошибки ISAM — -8. Не забывая мой код: blastall -l -e blastn 1e-3 -F F -feets 8 -a major 16 -d SRR1174221_read_db / seq_db -i SRR1174221_CUFF.16480.1.fasta -o SRR1174221_CUFF.16480.1.blastm8.

    Я успешно запустил formatdb.

    Любые стратегии приветствуются.

    Спасибо,
    Жан

    <тд>А

    <тд>

    Чжан Юепин

    Сигнал взрыва: код ошибки неудовлетворенности доступом к индексу франшизы ISAM определенно равен -12.<таблица>

    Чжан Цзюпин Показать общедоступный профиль Отправьте личный логотип, чтобы вы Чжан Юпин Найдите больше сообщений для Zhan Yueping

    Документы Defindit и инструкции по началу работы вне страницы

    Эта страница последний раз обновлялась в августе-июле 2009 года.

    Ключевые слова: blast, BLAST, ncbi, напоминание, выделить, ошибка, запрос, база данных, библиотека, refseq, номер, nt, fasta, formatdb, том, blastall, tblastxОписание: Причина и способ обхода самой важной ошибки NCBI BLAST «Bind Failed».title: Ошибка BLAST «Невозможно назначить»Я определенно видел ошибку сегмента BLAST, потенциально вирус выделения памяти, так как64-битные исполняемые фильмы (на 64-й операционной системе, слинкован конечно).С очень большими библиотеками обожают геномные ссылки, которые заполняют всю гаммуНаучная библиотека требует более 2 Гб связанной оперативной памяти (административный лимит 32 Гб).Маленький). Сообщение рассматривается как прекрасный показатель объема оперативной памяти.которые не могут быть выделены по сравнению с тем, что общая сумма уже использованаили уже запрашивается.Частично эффективным обходным путем, вероятно, является использование только одного «тома», содержащего файл a. относится кБаза данных. (Поиск в каждой библиотеке). Используйте refseq_genomic.00 илиrefseq_genomic.01. Обходные инструменты взрываются, но их можно получить только вполовине случаев вместе с tblastx. tblastx, похоже, почти ошибся в сегментепотратьте некоторое время на поиск refseq_genomic, даже в обратном направлении, если толькоНайдите раздел библиотеки NCBI Blast. Неудивительно, чтоТома ncbi сжаты на один конкретный ГБ.Последующее тестирование показало, что пробуя меньший объем одной из библиотекоколо 400 МБ, не думайте, что это вызывает сбой. Я скачал почти все refseqгеномный (также известный как «полный»), но я создаю свою собственную исследовательскую библиотеку.Команды типа:чат *.fna> фулл.фаст/bioinfo против blast/bin – formatdb -i complete.fasta -p F -u T -n refseq_genomic -v 1600(Для предметов, я думаю, пантере понадобилось 30 минут.получившийся трек “complete.fasta” считается примерно 105 ГБ.)По всему моему опыту вместе с кейсами последовательность применения жесткая.ulimit неограничен. Проблема, возникающая только в 32-битных системах.После дальнейшего тестирования мы обнаружили, что использование 64 NCBI BlastИсполняемые файлы с огромной 64-словной операционной системой не имеют ошибок.Вместо использования команды it to из-за -d, например:/ my_libs против refseq_genomic_20090630 / refseq_genomicСделайте несколько исследований, где -d:/my_libs/refseq_genomic_20090630/refseq_genomic.00/my_libs/refseq_genomic_20090630/refseq_genomic.01/my_libs/refseq_genomic_20090630/refseq_genomic.02Вместо этого вы можете настроить пакет Perl, который вы, вероятно, будете использовать для запуска BLAST.для повторения дополнительных всех частей базы данных. (ncbi не всегда ясно, что.00, .11, .02, сдавайся. являются «томами», но «том» уже используется в сообщенияхтекст инструкции подходит для formatdb, поэтому осмелюсь использовать номенклатуру фактов.)Ниже приведены некоторые часто используемые командные термины и сообщения об ошибках. Зевс обычно теперь 32-битныйЛинукс. Hera — это настоящая 64-битная версия Apple OSX с минимум 32 исполняемыми файлами la NCBI (например,на данный момент эта высота записи 64 и совсем не такая как NCBI OSX exe.)[zeus ~] $ /bioinfo/blast-2.2.18/bin/blastall -my blast_input.fasta -p blastn -F “T” -s 5 -TT -e 1e-10 -v Corporation -b 50 -M BLOSUM62 – A 5 -a 1 -d “/search_libs или refseq_genomic_20090630/refseq_genomic”[blastall] FATAL ERROR: 435153695 байт не могут быть выделены[hera~]$ /bioinfo/blast-2.2.18/bin/blastall -i blast_input.fasta -v blastn -F “T” -m 7 -TT -e 1e-10 -v 50 -b девяносто -M BLOSUM62 – А 0 -ваш первый -d”/search_libs для каждого refseq_genomic_20090630/refseq_genomic”blastall (55755) malloc: *** mmap (размер = 435154944) (код ошибки равен 12)*** Ошибка: невозможно просто попробовать добавить регион*** установите точку останова, найденную в malloc_error_break, чтобы помочь вам отладить[NULL_Caption] НЕИСПРАВНАЯ ОШИБКА: ошибка допуска 435153695 байт.[гера ~] $

    Вы не ошибетесь с этим инструментом исправления Windows. Если у вас возникли проблемы, просто нажмите на нее, и ваши проблемы будут решены.

    Fix And Fix Blastall Error Code 12
    Napraw I Napraw Kod Błędu Blastall 12
    Corrija E Corrija O Código De Erro 12 Do Blastall
    Fixa Och Fixa Blastall Felkod 12
    Corriger Et Corriger Le Code D’erreur Blastall 12
    Beheben Und Beheben Sie Den Blastall-Fehlercode 12
    Fix En Repareer Blastall-foutcode 12
    Arreglar Y Corregir El Código De Error 12 De Blastall
    Blastall 오류 코드 12 수정 및 수정
    Correggi E Correggi Il Codice Di Errore Blastall 12
    г.